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厭氧生物降解過程發生在缺氧環境中。為能給這樣的樣品測量瓶充氧需要一個密封的瓶口。厭氧降解發生時產生二氧化碳，然后用二氧化碳吸收液從氣體中去除。一定比例的二氧化碳及剩下的一定比例的甲烷濃度氣體。
降解過程都在壓力工作模式下進行。
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